Hãng hàng không quốc Copa Airlines (CM) của Panama có trụ sở tại Thành phố Panama. Hãng hàng không, là một thành viên của Star Alliance, cung cấp các chuyến bay thẳng đến khoảng 70 điểm tại 30 quốc gia ở Trung Mỹ, Bắc Mỹ, Nam Mỹ và vùng Caribbe. Đội tàu bay được bố trí với hai khoang hành khách: Hạng Thương gia và Hạng Phổ thông. Trung tâm trung chuyển của hãng nằm tại Sân bay Quốc tế Tocumen của Thành phố Panama (PTY). Các thành phố trọng điểm gồm có Sân bay Quốc tế El Dorado của Bogota (BOG), Sân bay Quốc tế La Aurora của Thành phố Guatemala (GUA), San Jose, Sân bay Quốc tế Juan Santamaría của Costa Rica (SJO) và Sân bay Quốc tế Augusto Sandino C. của Managua (MGA).